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生物信息学入门 · 四个实验

4 节 · 约 30 小时 · 入门(需要 Python 基础) · v2.0.0 · 更新于 2026-10-02

从序列到差异表达、富集分析与单细胞,沿四个公开数据实验学习分析流程。配前置说明、练习模板、参考解和结果核对,适合已有 Python 基础的学习者。

生信Python数据分析

四个实验都跑真实公开数据(人 TP53 mRNA、airway RNA-seq、MSigDB Hallmark、10x PBMC 3k),
每个实验都有一个能拿文献核对的已知答案 —— 比如 TP53 编码 393 aa。
用参考结果检查运行步骤与实现;统计解释还需要结合数据条件、方法假设和原始文献核对。

实验 1 的数据已内置,其余要自己下载。

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课程章节

  1. 01实验 1:序列基础(FASTA · GC 含量 · 反向互补 · 翻译 · ORF)6 小时
  2. 02实验 2:批量 RNA-seq 差异表达(真实数据 · PyDESeq2)10 小时
  3. 03实验 3:富集分析(ORA 超几何检验 · BH 校正 · GSEA)6 小时
  4. 04实验 4:单细胞 RNA-seq 入门(PBMC 3k · scanpy)8 小时